Das Gesundheitsamt kontrolliert die Qualität im Niels Stensen Pflegezentrum regelmäßig und umfangreich. So wird die Einrichtung unangemeldet von der Lebensmittelaufsicht inspiziert. Die Gesundheitsaufsicht kommt gemeinsam mit einem Arzt des Gesundheitsamtes zu regelmäßigen Heimbegehungen. Schwerpunkt der Überprüfungen sind die hygienischen Bedingungen, die Einhaltung der gesetzlichen Vorschriften und des Hygieneplans.